難點在于如何降低成本、提高產量。為此，科學家必須找到更經濟的方法來烘干綠藻，提取富含能量的油脂。

斯維格表示花費5美元的電力制造出1美元的燃油顯然是毫無意義的。他認為如果研究進展順利，需要5年時間將成本降至每加侖40美元。

但是獲取能源市場份額將會改變能源供應的格局。斯維格說：“酒精燃料只占能源總數的4%。4%確實不多，但絕對數字是非常大的。”

一些新興公司更加樂觀。佛羅里達阿爾基諾生物燃油公司總經理保羅-伍茲認為他的公司會在市場競爭中勝出，因為他擁有無需烘干就能夠從綠藻中蒸餾出酒精的專利技術。“我們獲取能源的方法成本低廉。”伍茲說：“提取酒精的成本越低，就越能擺脫對外國能源的依賴。”

伍茲于7月份宣布與陶氏化學公司合作建立實驗廠，計劃于2011年開始商業生產。

但是，專家認為綠藻能源不會完全取代化石能源，有人還認為這只是嘩眾取寵。他們說，綠藻能源觀念已經存在了數十年，但至今還沒有研發出可行性的途徑。

“很多想法都是看上去很美，但往往無功而返。”綠藻專家約翰-貝內曼說。相反，他認為綠藻除了能產油，還含有蛋白質、糖類等多種成分，因此可利用它們制成高附加值產品，如食品添加劑、保健品、動物飼料、藥物或者肥料等。

菲利比蒂斯也承認，目前還沒有新技術可以擺脫對化石燃料的依賴。但是他堅信很快會看到希望，特別是一些大公司開始進行綠藻研究。他說：“我們尚處于初級階段，但隨著產量增加，我相信能迅速降低成本。”