三、審計發現的主要問題
(一)項目執行概算尚未編制完成，投資控制目標不夠明確，投資控制管理尚待加強。
溪洛渡工程2003年開始籌建，已簽訂各類合同金額380億元，累計完成投資152億元，但三峽總公司至今尚未編制完成項目執行概算。因工程投資缺少分部門、分項目的控制標準和依據，建設中出現合同執行不嚴謹、工程造價審核把關不嚴等問題，導致工程建設成本增加，部分單項工程超過可研估算。統計264份完成比例在90%以上的建安工程合同，合同原始金額38.17億元，截至2008年8月底，投資累計增加10.97億元，增加比例達28.74%。由于沒有執行概算，審計難以對投資總體控制作出評價。
(二)大幅壓縮工期，一定程度上增加了工程建設風險。
根據可行性研究報告，溪洛渡工程計劃2002年初開始籌建，2008年11月金沙江截流。而實際2003年3月開始籌建，2007年11月完成金沙江截流。籌建工作較原計劃推遲15個月，截流提前12個月，合計壓縮工期27個月，加大了工程建設風險和難度，也增加了項目建設成本。統計45個對外交通建安工程，合同金額20.14億元，因趕工期等原因導致大量變更，最終結算金額26.85億元，變更率達33.32%。對外交通工程2003年8月開始詳勘，同年10月開工，由于勘察設計時間短，地質勘察不到位，發生F標大路梁子隧道突發瓦斯溢出并燃燒的重大安全事故，工程進口段停工34天。
(三)部分項目招投標管理不夠規范。
溪洛渡工程應招標分項目464項，合同金額248.98億元。實際執行中，未招標項目219項，占47.2%，合同金額16.79億元，占6.74%。
(四)部分關聯企業管理、履行職責不到位，獲取不當收益。
審計抽查參與溪洛渡工程建設的部分三峽總公司下屬企業，發現一些關聯企業收費偏高，履行職責不到位。如三峽總公司將溪洛渡工程的招標代理直接委托給下屬關聯企業三峽國際公司。根據三峽總公司內部招標代理收費標準，三峽國際公司收取代理費2571萬元，超出國家收費標準1010萬元。經對審計抽查的91個項目進行統計，由于招投標文件的編制和審查以及清標工作不到位，部分項目招標文件技術條款和商務條款描述歧義，導致投資增加5000多萬元。
2003年3月至2006年11月，三峽總公司將溪洛渡工程部分監理業務直接委托給下屬企業三峽發展公司，并簽訂17份工程監理和其他服務合同協議，合同總價15 328.69萬元，扣除成本費用，三峽發展公司取得收益3471.09萬元。在實際監理過程中，三峽發展公司現場人員投入嚴重不足，資質偏低，審核把關不嚴。抽查22個工程監理日記發現，監理人員跨崗位、跨項目、跨專業上崗現象嚴重；抽查2007年8月份人員名單發現，無監理員資格證上崗49人，占該公司溪洛渡工程監理部人員的23%。
此外，審計還發現，溪洛渡工程建設中部分項目合同管理及結算管理不夠嚴格，工程建設、生產、管理用房面積和投資超標，增大了工程建設成本；個別項目工程質量、安全管理還存在疏漏；概算多計列勘察設計費；部分環保項目未能達到規劃要求等。
(五)移民安置未如期完成。
主要是施工區移民安置尚未全部完成。2003年，為滿足工程建設需要，四川、云南兩省采取臨時過渡方式開始施工區移民搬遷。目前，四川省已完成施工區移民搬遷安置工作。云南省施工區移民安置實施規劃尚未修編完成。
此外，審計發現有14. 41億元移民資金因管理環節多，撥付不及時。
四、審計發現問題的處理情況及建議
針對審計發現問題，審計署已依法出具審計報告，下達了審計決定書。同時建議：
(一)三峽總公司應盡快編制完成項目執行概算，加強對工程動態投資的有效控制，建立科學合理的工程價差測算、結算機制，完善投資控制管理體系，切實提高建設資金使用效益。
(二)三峽總公司應進一步加強工程建設管理，嚴格執行招投標法，確保招投標公開、公平、公正；加強合同管理，提高招投標文件和合同條款的嚴密性和可操作性，嚴格執行合同約定，減少不合理支出；加強對關聯企業的管理，用市場機制引導其參與投標競爭，并監督下屬企業履行合同約定的義務和責任。
(三)國家有關部門和地方政府應加強協調和領導，妥善處理發展地方經濟與控制項目投資的矛盾，盡快完成移民安置實施規劃，切實落實移民安置政策，完善相關措施，確保社會穩定。
五、審計發現問題的整改情況
三峽總公司及其相關單位高度重視審計提出的問題和意見，把落實整改與加強內部控制管理結合起來，進一步規范了工程計量和合同管理，糾正違規金額3600多萬元。制定多項管理辦法，調整機構、充實監理人員、明晰崗位職責、加強崗位知識和技術培訓，完善了監理管理機制。對不合格施工企業及時清退，嚴格準入制度。 四川、云南兩省政府高度重視審計發現問題的整改工作，針對移民安置實施規劃滯后和政策不夠完善問題，積極研究妥善解決辦法。云南省政府已責成省移民局對移民資金實施嚴格的限時撥付制度，加快移民安置進度。
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